糯小麦含有98%以上的支链淀粉和小麦独有的面筋营养蛋白，具有较低的糊化温度、容易变性，以及具有较高的持水能力、较低的凝沉和老化速度等特点。糯小麦是一种新型的酿酒与食品原料，可用来开发新型白酒、营养糯质食品等高值产品，改良我国白酒以及现有食品的品质，并且在制药、造纸、化工以及制衣等领域具有特殊的利用价值，产业化前景十分广阔。研究所通过建立高效的糯小麦新品种分子育种技术，现选育出一批产量高、抗性好、农艺性状优良的全糯小麦。其中，中科糯麦1号、中科紫糯麦168和中科糯麦18已通过省级审定，中科紫糯麦168、糯麦12、白糯麦17和糯麦28等已获得国家新品种权保护授权。

目前，研究所所以育成的糯小麦新品种为主要原料，已进行新型白酒、全糯麦保健型汤圆及部分糯麦优质型面条等系列产品的开发工作;尤其深入研究了糯小麦为酿酒原料的酿酒工艺并进行了香型改良，提高产酒率10%，可较其他原料降低酿制成本30%以上。